Volontaire pour partir dans la galaxie de Pegase et plus précisement sur Atlantis, le Lieutenant Aiden Ford est un jeune militaire. Il fait partie des missions avec le Major John Sheppard, et devient même le second en charge du commandement.
Le Docteur Carson Beckett est le chef de l'équipe médicale. D'origine écossaise, il a un certain humour et est à l'origine du gène ATA, capable de transmettre aux humains la possibilité d'utiliser les technologies anciennes (même si ce n'est pas fiable à 100%).
Le Docteur Elisabeth Weir est une scientifique civile, brillante et experte dans le maniement des langues. Gérant le SGC après le départ du Général George Hammond, elle est remplacée par le Général Jack O'Neill et prend ainsi place en tant que leader de l'expédition Atlantis.
Le Major de l'US Air Force John Sheppard est un pilote d'hélicoptère doué fleurtant toujours avec les règles de la chaîne de commandement. Il est rattaché à l'expédition Atlantis lorsque Elisabeth Weir comprendra qu'il est un atout majeur pour son équipe (il possède le gène des Anciens).
Le Docteur Rodney McKay est le second meilleur expert de la Porte des Etoiles (bien qu'il revendique la première place à Samantha Carter...). Il a de l'humour, semble égoïste, et souvent peureux... mais au final, il finit toujours par aider ses camarades pour les sortir du pétrin.
Ronon Dex est un natif de la galaxie de Pégase. Il fut capturé, torturé puis relâché par les wraiths pour servir non seulement de gibier, mais aussi de divertissement et d'entraînement jusqu'à sa capture. Il rencontre l'expédition après 7 années de cavalerie...
Teyla Emmagan est une athosienne. Agée d'une vingtaine d'années, elle a perdu sa famille à cause des wraiths. Cependant, elle est le chef de son groupe, et se joint aux membres d'Atlantis. Elle aura un peu de mal à s'imposer, surtout parmi le chef de la sécurité, le Sergent Bates.