Version française du titre : Résistance 1/2

L'Enterprise débarque sur Terre, mais personne ne répond à leurs appels. Dans une navette, Mayweather et Reed essuient les tirs d'avions sortis tout droit d'une Seconde Guerre Mondiale quelque peu modifiée. En effet, les Allemands auraient envahit la partie Est des USA...
Version française du titre : Résistance 2/2

Le voyageur dans le temps Daniels, mourrant, demande à Archer d'empêcher Vosk d'ouvrir un portail temporel. Silik aide alors le Capitaine et quelques résistants à infiltrer l'usine où le vortex serait dissimulé.
Version française du titre : Retour au Bercail

De retour sur Terre, l'équipage retourne à la vie "normale". Archer part faire de l'escalade en compagnie du Capitaine Hernandez, Reed, Mayweather et Phlox vont dans un pub, et Trip se rend sur Vulcain où T'Pol va se marier...
Version française du titre : Les Améliorés

Un oiseau de proie Klingon a été attaqué par des individus génétiquement modifiés surnommés les Améliorés. Archer et son équipe partent les rechercher en compagnie du Docteur Arik Soong, leur créateur.
Version française du titre : Les Embryons

Soong et ses améliorés s'emparent de la station cryogénique 12, où se trouvent des milliers d'embryons. Pendant ce temps, Archer et l'Enterprise cherchent un moyen de les arrêter.
Version française du titre : Poursuite

Après que les Améliorés aient échappé à leur créateur, Soong est récupéré par l'Enterprise. Il les informe que ses enfants vont lancer une torpille contenant une souche de virus mortel sur une planète Klingon dans le but de créer une guerre entre les humains et leur empire.
Version française du titre : Le Pèlerin du Désert

Un attentat a eu lieu au sein de l'ambassade terrienne sur Vulcain, provoquant 40 morts dont l'Amiral Forrest. Tandis qu'Archer souhaite participer à l'enquête, l'Administrateur V'las l'en contraint et soupçonne par la même occasion le peuple syrranite.
Version française du titre : Les Dissidents

Archer et T'Pol ont trouvé les Syrranites. Mais T'Pau, leur leader, dément être à l'origine de ce carnage.
Version française du titre : Kir'Shara

Pendant qu'Archer, T'Pol et T'Pau tentent d'amener le Kir'Shara au Haut Commandement Vulcain, Trip et l'Enterprise vont tout faire pour éviter un conflit Vulcaino-Andorien.
Version française du titre : Le Puits Noir

Emory Erickson, l'inventeur de la téléportation, rend visite à l'équipage du NX-01 afin de tester un nouveau type de transport pouvant remplacer l'utilisation de vaisseaux pour le voyage sur de courtes distances dans l'espace.
Version française du titre : L'Expérience Témoin

Deux entités extraterrestres étudient en secret les membres de l'Enterprise, lorsqu'une infection virale contamine plusieurs membres du vaisseau...
Version française du titre : Rumeurs de Guerre

L'Enterprise, avec à son bord l'ambassadeur Tellarite en route vers Babel, intercepte un message de détresse venant du vaisseau de Shran...
Version française du titre : Pacte Fragile

Le Capitaine Jonathan Archer tente de réunir les Vulcains, les Andoriens et les Tellarites afin de stopper le vaisseau Romulien se préparant à attaquer la région.
Version française du titre : Les Pacifistes

Archer et Shran se rendent sur la planète d'origine de ce dernier afin de rencontrer une sous-espèce andorienne: les Aenar. Y trouveront-ils les responsables des différentes attaques de vaisseaux?
Version française du titre : Épidémie

L'Enterprise revient sur Terre pour le lancement du second vaisseau de classe NX, le Columbia. Au même moment, Phlox est kidnappé par les Klingons, ceux-ci souhaitant qu'il collabore avec eux pour trouver un remède contre un virus.
Version française du titre : Éradication

L'Enterprise, avec l'assistance du Columbia, partent à la poursuite des klingons...
Version française du titre : Le Lien

Archer reçoit trois femmes esclaves en cadeau suite à une négociation avec le Syndicat d'Orion.
Version française du titre : Le Côté Obscur du Miroir 1/2

Dans un univers miroir, les commandants Forrest et Archer de l'Empire Terrien pénètrent dans l'espace Tholien afin de récupérer un mystérieux vaisseau terrien provenant du futur...
Version française du titre : Le Côté Obscur du Miroir 2/2

L'USS Defiant, avec à son bord l'équipage du NX-01, a quitté l'espace Tholien et se dirige à présent vers la Terre.
Version française du titre : L'Enfant

L'annonce d'une future alliance entre les Vulcains, les Andoriens, les Tellarites et les Terriens se retrouve menacée lorsqu'un groupe d'humains extrémistes s'apprêtent à détruire le quartier général de Starfleet.
Version française du titre : Terra Prime

Trip, T'Pol et John Paxton, le leader de Terra Prime, se sont installés sur une colonie martienne. Paxton menace de mettre son plan à exécution si les « non-humains » ne quittent pas la Terre immédiatement.
Version française du titre : Le Dernier Voyage

Six ans après, le Capitaine Archer et son équipe reviennent sur Terre pour assister au désarmement de l'Enterprise ainsi qu'à la signature de la charte de la Fédération.